Après leur défaite aux régionales, la chorale redevient la risée de McKinley. Quand l'école fait face à de nouvelles coupes budgétaires, M. Schuester pousse les chanteurs à recruter de nouveaux membres pour la chorale. Rachel et Finn ne sont pas d'accord à propos des recrues et ne sont pas sûrs de rester en parfaite harmonie.

M. Schuester insiste pour que la chorale chante des titres populaires pour l'assemblée de l'école mais les élèves ont d'autres plans. Alors que les New Directions font campagne pour interpréter les meilleures chansons de Britney Spears, ils apprennent que Brittany a des liens avec la célèbre chanteuse. Pendant ce temps, Will rencontre le petit ami de Emma, Dr Carl, ce qui déclenche une rivalité entre les hommes alors qu'ils essaient d'attirer son attention.

Finn traverse une crise existentielle quand il croit voir le visage de Jésus sur son croque-monsieur. Parallèlement, le reste de la troupe se rallie autour de Kurt, dont le père tombe dans le coma après une attaque cardiaque, les amenant à de grandes discussions entre non-croyants et croyants.

Puck est envoyé en maison de redressement pour avoir crashé la voiture de sa mère dans le devanture d'un magasin et être reparti avec la caisse; Sam prend sa place dans la chorale. Les membres de la chorale doivent travailler sur des duos. Finn et Rachel font en sorte que Sam soit favorisé, et un triangle amoureux se développe entre Tina, Mike et Artie.

Will décide de faire jouer The Rocky Horror Show par le glee club pour le spectacle annuel de l'école après avoir appris qu'Emma adore cette comédie musicale culte. Malgré les manigances habituelles de Sue, les membres de la chorale injectent leur propre style dans des titres tels que The Time Warp ou Dammit, Janet!.

Kurt rencontre Blaine, un étudiant ouvertement gay de la Dalton Academy, une école pour garçons et songe à quitter McKinley pour cet établissement. Puck revient après avoir été en détention.

Un virus se répend à McKinley et Will n'est pas pas épargné. Malade, Holly Holliday est engagé pour reprendre sa classe d'espagnol et la chorale. Sue remplace le principal Figgins et ne résiste pas à l'envie d'abuser de son pouvoir.

La mère de Sue Sylvester vient rendre visite à sa fille, après une longue période d'absence, afin d'assister à son mariage. Dans le même temps, Kurt prend une décision importante après que Karofsky l'ait poussé dans ses derniers retranchements. Enfin, la chorale se réunit lors de la célébration du mariage de la mère de Finn et du père de Kurt.

La chorale se rend aux Sélections pour affronter les Warblers et les Hipsters. Emma et Carl se rapprochent alors que les romances adolescentes commencent à s'effilocher.

Brittany croyant toujours au père Noël, les New Directions décident de tout faire pour qu'elle ne découvre pas la vérité. Seulement voilà, Sue n'est pas loin et elle va essayer de tout faire échouer.

Un championnat local de football est organisé. Will et le coach Beiste essayent de faire travailler la chorale et les Titans ensemble. Sue fait tout ce qu'elle peut pour être sûre de remporter un nouveau championnat national avec les Cheerios.

L'amour est dans l'air à McKinley lorsque Finn met en place un stand de baiser pour la Saint Valentin. Les choses ne se passent pas comme prévu et les cœurs finissent par être brisés.

Rachel tente de se lancer dans un retour dans la haute stratosphère sociale de Mc Kinley avec l'aide de Brittany. Pendant ce temps, Sam monte un groupe.

Le principal Figgins enseigne à l'ensemble des étudiants les dangers de l'alcool chez les mineurs, et le Glee Club est personnellement touché par le message. Pendant ce temps, M. Schuester et Beiste se livrent à un peu d'amusement.

Will Schuester se rend compte que le Glee Club ne connait rien aux relations sexuelles. Il fait donc appel à Holly Holliday pour les aider. Mais Emma, présidente du Club d'abstinence, est contre cette idée. Santana quant à elle, se pose des questions sur ses sentiments pour Brittany. Du côté des Warblers, Kurt a du mal à révéler son côté "sexy".

Les New Directions affrontent les Warblers de la Dalton Academy ainsi qu'Aural Intensity aux régionales. Les chorales sont jugées par Kathy Griffin et Loretta Devine. Pendant ce temps, Quinn tente de reconquérir Finn pour devenir la reine de la promo à McKinley. Kurt et Blaine font un pas dans leur relation.

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