Après sa rencontre avec John le Rouge et la mort probable de Kristina, Patrick Jane n’est plus motivé pour travailler avec le CBI. Pour se remonter le moral, Patrick s'amuse à instaurer une peur subliminale des souris à l'homme de confiance de Madeleine. Cela irrite Teresa. Pendant ce temps, l'équipe enquête sur la disparition très médiatisée d'un haut placé et le meurtre de son chauffeur. Lisbon doit convaincre Jane de l'aider.

Patrick Jane est appelé par son beau-frère qui lui demande de l'aider alors qu'il est soupçonné d'avoir tué un homme d'affaires. Jane se doit alors d'intervenir, malgré ses problèmes personnels, pour retrouver son beau-frère et élucider l'affaire avant Lisbon.

L'équipe enquête sur une jeune femme retrouvée morte qui pourrait vraisemblablement faire partie de « Visualize ». Parallèlement, Jane tente de retrouver Kristina Frye avec l'aide inattendue de Bret Stiles, le « gourou de Visualize » .

Jane et l'équipe du CBI sont appelés pour le meurtre d'un homme d'abord condamné puis relâché sur preuves grâce à l'ADN. Les proches de ses victimes sont les premiers suspects.

Lorsqu'un jockey talentueux est retrouvé assassiné, l'équipe du CBI doit mener son enquête dans un hippodrome où les suspects ne manquent pas.

Patrick Jane et le CBI sont appelés pour résoudre le meurtre par balles d'un jeune homme. Cependant, il se trouve que sa fiancée, Abby, fille d'une juge réputée, a disparu. L'équipe se retrouve alors dans un complexe hautement sécurisé et sous la pression du juge qui souhaite retrouver sa fille afin de pouvoir enterrer en paix sa mère (grand-mère d'Abby) morte de cause naturelle. Patrick crée un scandale aux funérailles.

Lisbon et Jane sont appelés par le milliardaire Walter Mashburn, un ancien suspect, au sujet d'une menace de mort d'un entrepreneur, Yuri Bajoran. Mashburn souhaite racheter l'entreprise et veut s'assurer que le vendeur reste en vie. Peu de temps après avoir rencontré Yuri Bajoran, Walter, Lisbon et Patrick évitent une explosion de justesse. Tout au long de l'enquête, des étincelles ressurgissent entre Lisbon et Walter Mashburn.

Patrick Jane s'est fait kidnapper. L'équipe se voit alors obliger de fouiller dans les dossiers de celui-ci afin d'élaborer une liste de suspects pouvant lui en vouloir, autre que John le Rouge. L'équipe se rend vite compte que la plupart des personnes qu'il a rencontré lors des affaires précédentes ont des raisons de lui en vouloir. Pendant ce temps, Patrick se fait torturer.

Patrick Jane accepte l'aide d'Ellis Mars, un astrologue, afin de résoudre un triple meurtre impliquant deux policiers et la fiancée d'un ambulancier.

Après la mort d'un Père Noël, le CBI suit des pistes qui les emmènent dans un groupe « d’alcooliques anonymes » et à la « Société Nationale des vrais Pères Noël ».

L'équipe enquête sur le meurtre d'un journaliste lors d'un combat de freefight. Rigsby doit répondre à des questions embarassantes à LaRoche à propos du meurtre de Todd Johnson.

Patrick Jane estime que ses méthodes d'enquête sont supérieures à celles du docteur Montague, une profileuse. L'équipe enquêtera sur un double meurtre qui deviendra vite une compétition entre Patrick et le docteur Montague.

Un homme armé prend en otage un groupe de personne, dont Patrick Jane. Cet homme armé, qui est le suspect numéro 1 dans une affaire de meurtre, clame son innocence, mais personne ne le croit.

L'équipe enquête sur la mort d'un témoin que Van Pelt avait à sa charge. Entre temps, LaRoche continue son enquête sur la mort de Todd Johnson et c'est Van Pelt qui est visée. Craig O'laughing (l'amoureux de Grace) fait une demande à Van Pelt.

Au moment où l'équipe s'apprête à enquêter sur la mort d'un prospecteur d'or, Teresa se blesse à la cheville. Elle doit rester au bureau. L'agente Hightower prend donc la place de Lisbon. Madeleine Hightower doit composer avec ses problèmes personnels, quand ses enfants débarquent au CBI.

LaRoche poursuit son enquête sur la mort de Todd Johnson. Cinq suspects sont dans sa ligne de mire. La première suspecte à subir un interrogatoire est Madeleine Hightower. Entre temps, l'équipe enquête sur le meurtre d'un dealer dont le corps a été retrouvé dans un musée. Un lien est vite fait entre le meurtre du dealer et Todd Johnson. Bien vite, les soupçons de LaRoche envers un suspect se concrétisent.

L'équipe enquête sur la mort d'un docteur dont le corps a été retrouvé sur un terrain de golf. Au même moment, LaRoche annonce à Lisbon que c'est lui qui dirigera le CBI, suite au départ de Madeleine Hightower. LaRoche soupçonne Teresa d'avoir aidé Madeleine à s'enfuir. Comme elle nie tout ce que dit LaRoche, celui-ci la rétrograde. Cho est nommé à la place de Lisbon. Ce changement amènera des perturbations dans l'équipe, ce qui fera changer d'avis LaRoche. Patrick reçoit un cadeau d'un proche d'un patient de l'hôpital.

Un homme est retrouvé mort dans un champs. Le docteur Steiner est appelé pour examiner le corps. Patrick agace le docteur Steiner au grand désarroi de Teresa. Peu de temps après être parti, le docteur Steiner se fait voler le corps. Au cours de l'enquête, l'équipe découvre que l'homme avait déjà été kidannapé par des ovnis par le passé et ceux-ci ont fait des expériences sur lui. Patrick n'en croit pas un mot. Pendant que Grace se prend un temps pour chercher sa robe de mariée dans une boutique. Wayne est bouleversé en voyant Grace en robe de mariée.

L'équipe enquête sur la mort de John Flynn, le propriétaire (avec sa femme Erika) de l'agence de rencontre Symphonie. Plusieurs suspects sont sont sous surveillance du CBI : les clients de l'agence et les proches de John Flynn. Pendant que le reste de l'équipe enquête sur les autres suspects, Patrick soupçonne la femme du propriètaire d'avoir tuer son mari. Celle-ci nie, car au moment du meurtre, elle était avec une cliente dans le studio d'enregistrement. Au cours de l'enquête, Wayne fait la connaissance de Sarah, une cliente de l'agence Symphonie.

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