Dans cet épisode, les Experts découvrent le corps d'une femme. Mac Taylor suppose que sa mort est due à une overdose. Stella Bonasera a l'idée de faire une recherche dans la base de données des personnes disparues et retrouve cette femme dans la liste. Il s'agit de LeAnn Goodman et les Experts partent alors à la recherche de son mari Tim.

Stella Bonasera tient une place importante dans cet épisode des 'Experts : Manhattan' dont l'action se déroule autour d'une femme violée alors qu'elle traversait Central Park la nuit. La victime, Robin Prescott, décide de prendre un raccourci par le parc après que son taxi ait été bloqué dans la circulation. Et alors qu'elle traverse le parc, elle est agressée et violée, mais heureusement pas tuée si bien qu'elle peut raconter ce qui s'est passé. Malheureusement pour les experts, Robin ne se souvient plus de rien y compris pour ce qui est de l'endroit où elle a été agressée...

Une jeune femme fait le tour de la ville de New York en bus avec son petit ami. Elle se montre très excitée au moment de passer devant les studios de MTV et alors que le guide leur donne des informations sur Times Square, elle dit à son ami qu'elle souhaiterait qu'ils soient photographiés tous les deux devant MTV. Elle finit par repérer un passager qui a l'air de ne pas follement se passionner pour le voyage. Elle va donc le voir pour lui demander de prendre la photo mais elle n'obtient de lui aucune réponse. Elle s'aventure donc à soulever sa casquette et découvre alors un crâne humain en dessous...

Mac et Aiden enquêtent sur le meurtre d'un artiste à l'avenir prometteur, spécialisé dans le hip-hop, qui a été poignardé peu de temps après avoir gagné un concours réunissant les meilleurs D.J. et signé un contrat avec un nouveau label. Par ailleurs, Stella et Danny tentent d'en savoir plus sur la mort d'une créatrice de mode dont le corps a été retrouvé dans sa piscine.

Une explosion a lieu dans un tunnel en construction sous la ville. Les ouvriers fuient le chantier laissant derrière eux le corps d'une personne morte. L'homme retrouvé mort était un ouvrier du nom de Pete Riggs.

L'épisode commence avec une jambe humaine retrouvée par un garde de nuit au Chelsea Piers. La jambe porte des traces de traumatisme et une cicatrice autour du genou. Le garde de nuit dit n'avoir remarqué personne dans la zone et avoue avoir pensé dans un premier temps qu'il s'agissait d'un accessoire provenant du tournage de la série "Les Sopranos".

Un homme, très grièvement brûlé, surgit dans une rue de Chinatown. Lorsque les détectives arrivent sur les lieux pour constater le décès, une autre victime gît dans la salle des coffres d'une banque qu'elle était visiblement en train de cambrioler avec ses complices. Un agent de sécurité a également trouvé la mort durant le braquage. L'un des malfaiteurs semble s'être enfui par le bâtiment adjacent...

Mac et Stella ont à faire à deux scènes de crime aux antipodes l'une de l'autre : la Bourse et une Eglise. Mais sont-elles réellement si dissociées ? "Three Generations Are Enough" débute au marché d'echanges de New York : un endroit où les négociants utilisent une combinaison de signaux de mains et de cris pour conclure leurs affaires. On dit souvent que le stress est tel que peu de négociants survivent au-delà de 30 ans - et il semblerait que certains d'entre eux n'atteignent même pas cet âge lorsqu'un agent de la sécurité découvre un attaché case noir n'appartenant à personne.

L'officier Alcomo est tué à la suite d'un coup de feu. Au moment des faits, il tentait de juger d'un conflit entre un touriste britannique et un vendeur local. La balle qui a tué le policier, a terminé sa course dans le cheval de l'Officier, surnommé Officer Blue. Le cheval survit car la balle s'est logée dans une partie spécifique du cou de l'animal. Cependant, extraire cette balle conduirait à la mort de l'animal.

La somnambule, Ophelia DiChara était couverte de sang lorsqu'elle s'est littéralement heurtée à Mac Taylor sur la scène de crime. La femme tuée, Rachel Connolly était sa voisine. Des jeunes, jouant au basket dans la rue, l'ont découverte près de l'immeuble. Les experts ont suffisamment de preuves pour l'arrêter.

Une coupure de courant conduit Mac et Stella dans l'univers des sports extrêmes pour ce nouvel épisode des "Experts : Manhattan" intitulé "Tri-Borough". Il s'avère que la victime se prenait pour Spiderman. Dans une ville immense comme New York, les coupures de courant locales ne sont pas exceptionnelles et d'habitude, elles n'exigent pas plus qu'un contrôle de police pour voir si le voisinage est toujours paisible. Mais cette fois, ce sont Mac et Stella qui vont enquêter dans ce quartier du Queens où l'électricité a été coupée durant le match des Knicks de la nuit passée. Car contrairement à la plupart des coupures de courant, celle-ci est due à un jeune homme électrocuté.

L'épisode se déroule autour du "Westminster Kennel Club Dog Show" qui a lieu tous les ans au Madison Square Garden. Tous les propriétaires des chiens en compétition ne visent qu'une chose : remporter le titre tant convoîté de "Best In Show".

L'épisode débute avec le meurtre brutal d'un jeune homme, Paul Montasano, battu à mort avec une batte de baseball dans le parc de Van Cortland. Des traces dans la neige indiquent qu'il a été attaqué par trois voire quatre personnes. Les preuves montrent qu'il ne s'agit pas là d'une attaque au hasard. Les éclaboussures de sang qui recouvrent le visage de Paul révèlent qu'il a tiré sur quelqu'un la nuit où il a été attaqué.

Bien que l'épisode débute par un matin de Février frisqué, un groupe d'une vingtaine de personnes ne semblent pas tenir compte du temps. Ils sont tous rassemblés sur la plage de Coney Island, sautillant pour tenter de ne plus penser au froid. Et puis, ils se déshabillent et plongent dans l'eau. Ils tentent de résister quelques minutes au froid qui les tenaillent puis sortent de l'eau en prétendant qu'ils ont adoré l'expérience. Alors qu'ils partent, l'un des nageurs remarque qu'un bout de coffre ressort du sable. Curieux, il l'ouvre et découvre, horrifié, le corps d'un garçon mort à l'intérieur.

Lorsqu'une mariée s'écroule quelques instants avant son mariage, Mac et Danny enquêtent sur cette mort mystérieuse. Le docteur Hawkes doit effectuer l'autopsie de la mariée mais son travail est entravé par le père de la mariée qui demande que le corps soit béni par un rabbin avant toute chose. Pendant ce temps, Stella, Aiden et Don Flack enquêtent sur la découverte d'un corps sans mains retrouvé dans un monastère de Staten Island. Des rumeurs disent que l'endroit est hanté par des moines assassinés dans ce lieu saint.

Mac et Stella sont appelés sur une scène de crime où ils découvrent la moitié inférieure d'un corps enterré sous un container. L'action se déroule sur un dock en pleine activité de Staten Island. Le travail sur le dock doit être interrompu pour retrouver l'autre partie du corps parmi les containers.

Le propriétaire d'un magasin de vins est retrouvé mort dans sa piscine remplie d'un mélange de vin rouge et de son propre sang. Les caméras de surveillance ont montré ce qui s'était passé à savoir le hold up de trois individus masqués menaçant le propriétaire de leur arme. Celui-ci a vidé son tiroir caisse pour leur en donner le contenu mais ça n'a pas suffi et il a été abattu par les hommes. Lorsque Mac, Stella et Flack arrivent sur les lieux, ils savent que la tâche ne sera pas aisée puisque les seuls indices que donne la vidéo sont que les braqueurs sont hispanniques et que l'un d'entre eux se prénomme Hector.

Au 65ème étage du building de NBC au Rockfeller Center, la principale attraction du Rainbow Room est sa vue panoramique très impressionnante sur Manhattan. Ce soir, le night-club accueille la commission Mollen, une commission indépendante chargée d'enquêter sur la corruption au sein du NYPD et du Bureau des affaires internes. Le commissaire principal Dan Stanwyk invite une belle blonde originaire du Kentucky à danser quand tout à coup, une explosion retentit et les baies vitrées explosent en mille morceaux. Des coups de feu éclatent, certains s'effondrent, dont Stanwyk... Lorsque Mac et Stella arrivent sur les lieux, les membres de la commission confient qu'ils sont persuadés que cette attaque prouve l'exactitude de leurs découvertes et demandent à Mac de retrouver celui qui a tué Stanwyk... Mais la tâche est ardue : toutes les balles ont échoué dans le sol ou dans les murs et il n'en reste que des fragments. De plus, l'arme du crime semble s'être volatilisée...

Le corps d'une jeune femme est découvert dans une laverie. Les draps de lit dans lesquels elle est enveloppée conduisent Mac et Stella dans un hôtel de New York haut de gamme qui accueillent les diplomates du monde entier lorsque les Nations Unies se réunissent lors de sessions extraordinaires. Pendant ce temps, Danny et Aiden enquêtent sur la mort d'un sans abri retrouvé habillé comme une statue humaine. Tout le monde voit dans cette affaire une farce mais Danny veut creuser plus en profondeur et son refus d'arrêter l'enquête le mène à un conflit avec Mac.

Un étudiant est retrouvé mort. Son appartement a été saccagé et tout porte à croire qu'il s'agit d'un crime lié à une affaire de drogue. Les experts se mettent à la poursuite des meurtriers. Après avoir examiné les preuves dans l'appartement de la victime, l'équipe trouve des traces d'héroïne pure et découvre que l'étudiant avait une colocataire qui a disparu. Parallèlement, Stella se lance dans un interrogatoire particulièrement agressif sur un témoin. Cette attitude menace la pérennité de son poste au sein des experts.

Alors qu'il travaillait sur une scène de crime, Danny est soudainement attaqué par un suspect caché dans le placard de la victime. La course poursuite qui suit conduit le suspect et l'agent dans le métro de New York. Des coups de feu sont tirés et lorsque ceux-ci s'arrêtent, un homme est à terre. Mais il ne s'agit pas du suspect qui court toujours. Au contraire c'est un policier qui a été tué et Danny se retrouve alors mis en examen pour le possible meurtre de son collègue. Mac Taylor doit prouver qui a tué le policier pour sauver le boulot de Danny. Pendant ce temps, Stella enquête sur la mort d'une nounou tuée dans des toilettes de Central Park.

L'équipe des experts enquêtent sur le meurtre d'un fan des Red Sox retrouvé mort après une sévère défaite contre New York. Danny doit utiliser ses talents en matière de baseball pour rassembler les pièces du puzzle et essayer de trouver comment et pourquoi il a été tué. Pendant ce temps, après avoir témoigné lors d'un procès pour meurtre, Mac doit faire face au condamné, Quinn Sullivan qui remet en question la validité des preuves. Mac est déchiré entre la fiabilité scientifique et son désir d'aider un homme qui face à la prison jure qu'il est innocent. Parallèlement, les experts enquêtent sur la mort d'une femme, renversée par un camion tandis qu'elle courait sur la route.

Alors que Mac déjeune dans son restaurant habituel, un homme ouvre le feu, tuant un homme et blessant une jeune femme. Mac doit choisir entre poursuivre le coupable ou porter secours à la jeune femme. Peu après, une invitation inattendue pousse Mac à se demander s'il est prêt pour une nouvelle histoire après la mort tragique de sa femme.