L’agent Beckett n'a plus de nouvelles de Richard Castle depuis des mois : la seule fois où Beckett, Ryan et Esposito l'ont aperçu, c'était sur une affiche publicitaire dans une librairie annonçant une séance d'autographes pour la sortie de son livre. Puis, Beckett se voit confier d'une nouvelle enquête et après avoir étudié la scène de crime et interrogé quelques témoins, Beckett et son équipe se rendent dans un appartement à la recherche du meurtrier. Et là, la surprise est totale car c'est Castle, une arme à la main, au-dessus du cadavre d'une femme qui se trouve être sur les lieux. Bien que Castle essaie tant bien que mal de clamer son innocence, Beckett se voit dans l'obligation de l'arrêter en tant que suspect principal du meurtre.

Une voyante, très en vue et connue pour avoir participé à la résolution d'affaires criminelles, est retrouvée assassinée dans son bureau. Castle choisit de croire au côté ésotérique de l'affaire, contrairement à Beckett.

La mort d'un prêteur sur gages entraîne une enquête pour Castle et Beckett impliquant un prêtre, un voyou, un homme en déambulateur, et un message codé. Durant l'enquête, Beckett se fait aider par un chasseur de primes qui n'est autre que son instructeur à l'époque où elle voulait devenir policière. Castle ne peut que constater la tournure romantique que prennent les événements.

Beckett est appelée pour résoudre le meurtre d'un jeune mathématicien. Sur le cadavre, on découvre qu'il a été tué par une balle qui date de deux cents ans. Cela met la puce à l'oreille de Castle, qui se remémore des idées saugrenues à propos d'un meurtrier qui voyagerait dans le temps. L'enquête les conduit à une voiture, semblable à celle du film Retour vers le futur et un suspect s'habillant à la mode du XIXe siècle. Castle a soudain une idée farfelue…

Le mystère est entier lorsque, à un enterrement, des porteurs funéraires font tomber un cercueil étonnamment lourd et découvrent à l’intérieur le corps d’une femme inconnue à côté de celui de la défunte. Castle et l’agent Beckett apprennent que la victime était un docteur à l’hôpital County, l’enquête les entraîne alors dans un monde de médecins infidèles et coureurs de jupons. Pendant ce temps, Gina tente de se rapprocher d’Alexis, ce qui met en péril sa relation avec Castle.

Quand une jolie femme est retrouvée morte dans une allée, tous les indices semblent indiquer un nouveau meurtre du célèbre serial killer, the Triple Killer. Ce dernier, aussi appelé 3XK, avait semé la terreur il y a 4 ans dans tout New York, puis disparu mystérieusement. Castle et l’agent Beckett doivent jouer au plus fin contre lui et entament une course contre la montre pour l’arrêter avant qu’il ne fasse d’autres victimes. Lors de l'enquête, un rapprochement entre Beckett et Castle s'opère.

Un jeune acteur travaillant comme strip-teaser est retrouvé mort dans la rue. Castle et Beckett découvrent que le comédien avait beaucoup de secrets, comme sa liaison avec une héritière et son travail dans un club.

Un électricien du métro new-yorkais est retrouvé assassiné par trois balles dans Central Park. Ce qui semble être une sombre histoire de trafic d'ampoules et d'ornithologie cache une histoire de kidnapping.

Une scientifique en charge d'études du ciel est retrouvée morte, tuée par un accident de décompression violent. Tout mène Castle à penser que les coupables viendraient d'ailleurs.

Le corps d'un docker est retrouvé dans l'East River, tué d'un coup violent à la tête. Les investigations de Castle et Beckett vont les mener vers un bar cachant un secret depuis la Prohibition.

Le roman de Castle est adapté pour le cinéma et l’actrice Natalie Rhodes, hollywoodienne et sexy, a été retenue pour le premier rôle. Elle rejoint à sa demande l’agent Beckett pour mieux cerner son personnage, dont elle devra interpréter le double littéraire. Alors que les trois protagonistes enquêtent sur le meurtre d’une marieuse de renom, Natalie va très loin dans son rôle de composition et devient le portrait craché de Beckett, ce qui ne manque pas de plaire à Castle et d’exaspérer Beckett.

Quand le propriétaire du magasin historique de New York “La magie de Drake” est retrouvé noyé dans le célèbre réservoir d’eau à torture d’Houdini, Castle et l’agent Beckett doivent plonger dans le monde de la magie, des magiciens et de leurs secrets afin de trouver son assassin. Au cours de leur enquête, Castle et Beckett rencontrent un maître de la magie, Tobias Strange. Pendant ce temps, on découvre que les magiciens ne sont pas les seuls à garder des secrets puisqu’une nouvelle idylle romantique se trame entre Esposito et Lanie.

Lorsque le détective qui enquêtait sur l’assassinat de la mère de Beckett se fait abattre sous ses yeux avant qu'il n'ait pu révéler de nouvelles informations sur l'affaire, les vieilles blessures de Beckett se rouvrent. Accompagné par Castle, Beckett et son équipe poursuivent l'enquête. Ils découvrent un élément pouvant leur révéler le responsable, mais Beckett est trop impliquée pour que son chef la laisse enquêter officiellement. En parallèle, durant cette enquête, le partenariat entre Beckett et Castle prend un tout autre niveau.

Castle et Beckett enquêtent sur la mort d'un homme ayant gagné près de 100 millions de dollars à la loterie, qu'il a dépensés de façons très diverses. La mère de Castle découvre qu'elle a également reçu un million de dollars en héritage de Chet, mais elle ignore quoi en faire.

Une nouvelle affaire est confiée à Beckett et son équipe. Une femme mariée a été tuée. Au fil de l'enquête, le principal suspect se révèle être le mari de la victime. Cependant, celui-ci est un ami d'enfance de Castle, qui refuse d'admettre que son ami est un assassin. Beckett lui reproche de trop s'impliquer dans l'affaire et lui demande de partir. Castle se met alors à penser que soit Beckett va arrêter un innocent, soit son ami est vraiment un tueur.

Un conducteur de taxi new-yorkais a été tué suite à un vol qui a mal tourné. Au cours de l'enquête, Castle et Beckett découvrent que la victime était impliquée dans une grande conspiration avec des répercussions inimaginables. Cette affaire prend trop d'ampleur et elle est confiée à l'agent fédéral Mark Fallon. Ensemble, ils doivent découvrir la vérité à propos de la victime avant qu'il ne soit trop tard et qu'une catastrophe se produise.

Après s'être fait piéger par les terroristes, Castle et Beckett se font sauver par la police de New-York. Ils doivent cependant continuer de travailler avec l'agent Mark Fallon pour trouver la bombe qui menace de détruire tout New-York. Seul le temps sera l'ennemi du duo de choc.

Une scénariste se fait tuer sur le plateau de tournage de son soap opera. Entre sa mère qui veut retourner sur un plateau de tournage qu'elle a arpenté et Beckett qui semble bien connaître la série, Castle déborde d'idées.

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre d’un juré survenu en plein procès pour homicide. Durant le procès très médiatisé du meurtre d’un notable, un juré s’écroule brusquement de son siège, mort. Alors que Castle et Beckett apprennent que le juré a été empoisonné, leur enquête révèle que ce juré en apparence si innocent ne l’était peut-être pas tant que ça.

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