Une jeune institutrice d'école maternelle est conduite a CHU de Princeton après s'être évanouie en plein milieu de sa classe. House et son équipe de spécialiste pensent à une tumeur au cerveau mais l'hypothèse est rejetée suite à une série de tests et d'examens. Afin de découvrir ce qui est en train de tuer sa patiente, House envoie le nouvel arrivant Dr Foreman chercher des réponses au domicile de la jeune femme...

Dan, un adolescent de 16 ans en proie à des cauchemars récurrents, est régulièrement victime de crises d'hallucinations. Lors d'un match de cross, il est frappé à la tête. Le Docteur House pense qu'il est atteint d'une maladie du cerveau et qu'une intervention chirurgicale, très risquée, est nécessaire pour sauver la vie du garçon...

Un étudiant s'évanouit dans les bras de sa petite amie. Hospitalisé au CHU de Princeton, son état ne fait que s'aggraver. Il présente un nombre de symptômes impressionnants, qui empêchent tout diagnostic. L'équipe tente plusieurs traitements. Après avoir bien réagi à une thérapie, le patient s'enfonce : il n'a plus de défense immunitaire et doit être isolé dans une chambre stérile...

Deux bébés, nés au CHU de Princeton, tombent malade. Ils présentent des symptômes identiques. Le docteur House s'oppose une nouvelle fois à la directrice de l'hôpital : il est persuadé qu'il s'agit d'une épidémie et qu'il faut réagir vite. Effectivement, en quelques heures, plusieurs nourrissons sont atteints du même mal. Ils sont tous placés en quarantaine tandis que la salle d'accouchement est fermée...

Une nonne est hospitalisée dans le service du docteur House pour des symptômes d'allergie aiguë. Le médecin lui administre un traitement antihistaminique auquel elle réagit très violemment. Elle présente une détresse respiratoire qui met sa vie en danger. Chaque nouveau traitement ne fait qu'aggraver son état. En désespoir de cause, House envoie Chase au monastère, enquêter sur l'environnement de la patiente...

Une femme, atteinte de schizophrénie, présente des troubles qui n'ont aucun lien avec sa pathologie. Après examen, l'équipe du docteur House découvre qu'elle a une tumeur...

Elyce Snow, une enseignante, est hospitalisée pour de graves troubles du sommeil. Elle dort près de dix-huit heures par jour, ce qui perturbe sa vie professionnelle et familiale. House, qui n'est pas très intéressé par son cas, diagnostique une dépression. Mais une réflexion apparemment anodine de l'époux d'Elyce l'intrigue. Il fait faire des examens complémentaires. Après avoir longuement tâtonné, House et son équipe établissent que l'enseignante souffre probablement de la maladie du sommeil, un mal endémique en Afrique. Mais aucun des deux époux n'a jamais posé le pied sur ce continent. House doit déterminer de quelle façon sa patiente a contracté cette maladie...

Un lycéen est hospitalisé, victime d'un empoisonnement. Le docteur House, persuadé que le jeune patient a pris de la drogue, envoie Cameron et Chase fouiller la maison familiale. Les deux médecins reviennent bredouilles. Un deuxième adolescent, présentant les mêmes symptomes, est à son tour admis à l'hôpital...

John Henry Giles, un célèbre trompettiste de jazz, est hospitalisé pour une pneumonie. Cette affection peut lui être fatale, le musicien étant affaibli par la maladie de Charcot, une maladie dégénérative. Il demande à ne pas être réanimé en cas de problème. Mais le docteur House, qui est un admirateur de Giles, émet des doutes sur le diagnostic. Lorsque le musicien s'enfonce, House passe outre sa volonté et le réanime. Son intervention lui vaut d'être traîné en justice par les proches de Giles. Pendant le procès, l'état du patient s'améliore inexplicablement...

Le docteur Foreman est persuadé qu'une sans-abri joue les malades afin de passer la nuit à l'hôpital. Wilson, qui ne partage pas l'avis de son collègue, demande conseil au docteur House. Celui-ci est intrigué à la fois par les symptômes que présente la patiente et par l'intérêt très marqué de Wilson pour ce cas...

Le docteur House s'occupe d'un jeune homme de seize ans victime d'un accident de voiture. Il doit comprendre pourquoi il n'arrête pas de saigner. Entretemps, il accepte de relever un défi lancé par Lisa : ne pas prendre de Vicodine pendant une semaine. S'il y parvient, il sera dispensé de gardes pendant un mois. Mais les symptômes de manque ne tardent pas à apparaître et les collègues de House s'inquiètent de la qualité de ses diagnostics. Foreman et Cameron craignent pour la vie des patients...

Hank Wiggen, un lanceur de base-ball de première division sur le retour, arrive à l'hôpital avec une grave fracture du bras. Les examens révèlent un problème osseux et le docteur House soupçonne Wiggen de cacher qu'il prend des stéroïdes. Les reins de Wiggen commencent à faiblir et sa femme propose de lui en donner un. Mais pour cela, elle doit renoncer à sa grossesse...

Un garçon de douze ans présente des symptômes comparables à ceux d'une pneumonie. Le père de l'enfant, un homme d'affaires qui fait d'importants dons financiers à l'hôpital, fait pression sur le docteur House pour qu'il se concentre exclusivement sur le cas de son fils. Le garçon est persuadé qu'il est victime d'un mauvais sort et que rien ne pourra le guérir. Parallèlement, House fait la connaissance du père de Chase, un médecin installé en Australie. Il est surpris de découvrir que le père et le fils entretiennent des relations glaciales...

Edward Vogler, un riche entrepreneur, est élu à la tête du conseil d'administration de l'hôpital. Il a l'intention de transformer l'établissement en centre de recherche spécialisé dans les maladies incurables. Pour mener son projet à bien, Vogler veut sacrifier le service du docteur House, jugé trop peu rentable...

Joey Arnello, un gangster, est appelé à témoigner contre la mafia. Peu de temps avant son arrivée au tribunal, l'homme s'effondre et sombre dans le coma. La cour charge le docteur House de déterminer si Arnello a provoqué son malaise afin d'éviter le procès. Bill, le frère du patient, s'arrange bien de cette situation et fait tout son possible pour ralentir le diagnostic. De son côté, Cuddy tente de convaincre Vogler que le service du docteur House est essentiel au bon fonctionnement de l'hôpital...

Conformément aux ordres de Vogler, le docteur House doit licencier l'un des médecins de son équipe. Il a une semaine pour faire son choix. Parallèlement, il s'occupe d'une fillette obèse de dix ans, hospitalisée après une crise cardiaque...

Au cours d'un meeting politique, le sénateur Gary Wright est victime d'un malaise. Il est transporté à l'hôpital de Princeton. Vogler insite pour que House s'occupe personnellement de Wright, un homme politique très en vue. Les premiers examens révèlent que le patient est atteint du sida. Par ailleurs, Vogler propose un marché au docteur House : s'il accepte de faire un discours lors d'une conférence médicale pour vanter les mérites de son entreprise pharmaceutique, Vogler s'engage à ne licencier aucun membre de son équipe...

Vogler ne décolère pas depuis le discours du docteur House lors de la conférence de cardiologie. Il est déterminé à obtenir le renvoi du médecin. Une femme enceinte est hospitalisée dans un état grave. Ses reins et son cerveau souffrent de dysfonctionnements sévères. Le diagnostic est sans appel. La jeune femme est atteinte d'un cancer. Elle doit subir une radiothérapie qui la sauvera mais sera fatale à son bébé. La patiente, qui a déjà fait trois fausses couches, refuse le traitement...

C'est le chaos à l'hôpital : les patients arrivent en nombre en raison d'une épidémie de méningite. L'attention du docteur House est attirée par une fille de douze ans. Les symptômes que présente l'adolescente sont légèrement différents de ceux des autres malades. Lisa Cuddy donne une heure au médecin et à son équipe pour s'occuper exclusivement d'elle. Au-delà, ils devront prendre en charge les nombreux patients qui se trouvent en salle d'attente... -

L'hôpital bruisse de rumeurs. Le docteur House et Allison Cameron ont un rendez-vous qui n'a rien de professionnel. James et Lisa ne se privent pas de leur donner des conseils afin que leur tête-à-tête se passe bien. Parallèlement, House a un problème avec un patient. Il l'effraye tant que celui-ci a une attaque...

Stacy Warner, l'ex-compagne du docteur House, réapparaît soudain dans sa vie après cinq années de silence. Elle lui demande de sauver son époux qui souffre d'un mal inconnu. Le médecin hésite, la demande de Stacy réveillant en lui des souvenirs douloureux. Par ailleurs, Lisa Cuddy le contraint à donner un cours sur le diagnostic à un groupe d'étudiants en médecine. House décide de leur présenter trois cas. Parmi ses trois exemples, il n'hésite pas à utiliser sa propre histoire...

Le docteur House accepte finalement de s'occuper de Mark, l'époux de Stacy. Les examens ne révèlent aucune anomalie et cependant l'état de Mark ne cesse d'empirer. House refuse de baisser les bras et se montre de plus en plus exigeant avec son équipe. James s'inquiète de son comportement...